Wilayah Mangystau mencakup banyak lanskap dan gurun yang berbeda: dataran rendah Kaspia, dataran tinggi (Usturt, Mangyshlak, Kendirli-Kayasan), pegunungan (Aktau, Karatau), rongga, gurun, pegunungan, dan pegunungan. Lanskap semacam itu membentuk labirin bertingkat asli, dicat dengan sedimen lempung hijau, kuning, merah muda dan merah. Titik tertinggi adalah gunung Otpan pada 556 meter (1,824 kaki). Titik terendah adalah dasar rongga Karagie, 132 meter (433 kaki) di bawah permukaan laut.