Le territoire de Mangystau comprend de nombreux paysages et terrains désertiques différents : les basses terres de la Caspian, les plateaux (Usturt, Mangyshlak, Kendirli-Kayasan), les montagnes (Aktau, Karatau), les grottes, le désert, les montagnes et les sommets montagneux. Ce type de paysage forme un dédale original à plusieurs niveaux, peint avec des sédiments de limons verts, jaunes, roses et rouges. Le point le plus élevé est la montagne Otpan à 556 mètres (1,824 ft). Le point le plus bas se trouve le fond de la vallée de Karagie, à 132 mètres (433 ft) sous le niveau de la mer.